По данным следствия, Корнишин, проходя военную службу на руководящих должностях в центральном аппарате Железнодорожных войск Российской Федерации, в период с 2000 г. по 2004 г., используя свое служебное положение, добился незаконного выделения двух квартир: знакомой ему женщине — в Хабаровском крае, а также подчиненному офицеру — в Москве.
В частности, как полагает следствие, Корнишин помог своей знакомой получить двухкомнатную квартиру в городе Хабаровске взамен однокомнатной. Принадлежащее женщине жилье он переоформил на свою мать, а затем продал. Кроме того, бывший заместитель командующего Железнодорожными войсками добился выделения подчиненному сотруднику жилья в Москве. Деньги, полученные офицером от продажи трехкомнатной квартиры в Хабаровске, Корнишин присвоил.В результате мошеннических действий Евгения Корнишина администрации города Хабаровска был причинен ущерб на сумму около 5 миллионов рублей.
В настоящее время материалы уголовного дела направлены в Московский гарнизонный военный суд для рассмотрения по существу.
Ранее, в январе 2009 года, Корнишин уже был осужден за мошенничество с квартирами в городе Москве. Ему назначено наказание в виде 5 лет лишения свободы с отбыванием в исправительной колонии общего режима.