Первый в России морской заповедник охраняет уникальные природные комплексы акватории и островов залива Петра Великого Японского моря. Заповедник расположен в западной части Японского моря. Он занимает около 10% площади залива Петра Великого – самой южной и тепловодной акватории дальневосточных морей России.
Заповедник с площадью островов немногим более 1000 га охраняет около 40% видов сосудистых растений от числа известных для Приморского края.
Полный список птиц морского заповедника насчитывает 370 видов.
Воды и дно заповедника населяет более 2130 видов животных и растений – это самая богатая по видовому разнообразию акватория среди морей России.
Об обитателях заповедника рассказывают сотни статей опубликованных в научных и популярных изданиях.
В состав Дальневосточного морского заповедника входит единственный в России расположенный на островной территории естественно - исторический музей. Музей "Природы моря и ее охраны" был создан дальневосточными учеными Российской Академии наук для того, чтобы познакомить людей с удивительным миром моря, рассказать о проблемах и угрозах его существования. За годы работы музей посетили более 120 тысяч человек. На о. Попова, в эколого-просветительской зоне заповедника находятся Центр экологического просвещения и Островной ботанический сад. По экологическим маршрутам прошло более 30 тысяч человек.
В 2003 году заповедник получил статус биосферного, был включен ЮНЕСКО в сеть Всемирно охраняемых территорий и акваторий.
К юбилею заповедника издана научно-популярная книга "Заповедное море" автор которой – директор заповедника к.б.н А.Н. Малютин.