Закон вносит изменения в часть вторую Налогового кодекса РФ и некоторые законодательные акты.
При применении налогоплательщиками новой системы налогообложения обязанность уплачивать целый ряд налогов, в том числе, налог на добавленную стоимость, заменяется обязанностью уплатить единый сельскохозяйственный налог по ставке 6%, что приведет к значительному снижению налоговой нагрузки на предприятия рыбохозяйственного комплекса.
Закон освобождает от уплаты налога на добавленную стоимость и таможенных пошлин организации, которые ввозят на таможенную территорию РФ российские суда рыбопромыслового флота, ранее вывезенные за ее пределы для капитального ремонта и модернизации, при условии, что эти работы были завершены до 1 сентября 2008 года. Освобождение предоставляется до 1 января 2010 года.
Кроме того, федеральный закон определяет порядок обложения ресурсов, выловленных в качестве приловов, сбором за пользование водными биологическими ресурсами. Раньше такой порядок не был определен.
Закон был принят Госдумой 24 декабря 2008 года и одобрен Советом Федерации 29 декабря 2008 года.